language2go:

Short words (basic equivalents of “what?”)

hein? - huh?
comment? - what was that/ what?
pardon? - excuse me, what?
qu'est-ce que vous avez dit? - what (did you say)?
t'as dit quoi? - what did ya say? (very, very informal)

Expressing you didn’t understand

je ne suis pas sûr d'avoir compris - I’m not sure I understood
Je n'ai pas compris - I didn’t understand
Je ne l'ai pas entendue - I didn’t hear it

Asking for repetition and/or slower pace

plus lentement s'il vous plaît - slower please
pourriez-vous répéter s'il vous plaît? - could you please repeat?